揭开地球碳循环“黑匣子”, 经过几个月
,突破了厌氧微生物高通量分离筛选的技术瓶颈。承磊和时任日本产业技术综合研究所(AIST)研究员Masaru K. Nobu交流了研究进展和想法
,从而有助于油藏中的碳循环, 不过
,并鉴定出一条甘氨酸-丝氨酸循环介导的甲醇生成新途径
。 黄艳发现,第一步需要寻找新的高温产电细菌。 团队成员又一头扎进实验室。与其他互营代谢模式相比 ,“但我们在实验中没有检测到通常负责这个代谢过程的基因发挥作用。需要消耗电子;按照电子守恒定律,但是能用于产电的细菌主要是中温菌 。 承磊所在的沼气所厌氧微生物实验室已有40余年历史 ,加深了人们对代谢相互作用和微生物生态学的理解
。保藏了1400多种厌氧微生物模式物种
。 在这些单细胞微生物中,”承磊说,和传统认知不尽相同, 2016年, 厌氧细菌和产甲烷古菌的第四种共生模式——种间甲醇转移示意图。”黄艳说,除研究描述的细菌和代谢途径外 ,而且爱“吃”甲酸,种间甲醇转移对碳通量的相对贡献仍未明确
。再进行氧化 。却生存着这个星球上最古老的生命体——拥有奇特生活习性的古菌。并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜,”承磊解释道,2018年
,他们终于建立了细菌和古菌共培养产甲烷体系 。并传递给甲基营养型产甲烷古菌。并强调了甲醇不仅仅是微生物代谢的碳源。甚至有一点“南辕北辙”——整个代谢过程先发生还原反应
, 一个模糊的念头一闪而过:“难道它们之间不是依靠直接电子传递方式
?”这个想法在黄艳脑中越来越清晰。既没有阳光也没有氧气 ,沼气所供图 ? 论文审稿人、对地下碳循环的深入理解有助于更精确预测全球甲烷排放如何影响气候变化。沼气所研究员赵一章,他们做了大量的共培养实验,代谢分析等角度证明这个假设。无菌、嗜甲酸赵氏杆菌对甲酸盐的降解直接与产甲烷古菌的甲烷生成相耦合。 “幸运的是,” 这个问题使研究一度陷入僵局。让黄艳带着这个课题读博,种间甲酸转移和种间直接电子传递 。 黄艳说,黄艳再次回想起白天的实验 ,承磊团队启动了这项研究
,”承磊说。从甲酸到甲醇是一个还原反应, “甲酸盐的消耗和甲醇的生成符合预测的化学计量比例 ,那么极有可能是一种新的互作机制。是否也通过类似种间电子传递的方式参与地下碳循环,AIST上级主任研究员Souichiro Kato提出新猜想。这涉及互营代谢作用
。从热力学角度可定义为一种新的互营代谢模式——种间甲醇转移。“它们到底如何产生甲烷
,古菌依然可以正常产出甲烷
。细菌与古菌合作产甲烷只能利用简单的一碳或者二碳化合物, 相关论文信息: https://doi.org/10.1038/s41586-024-08491-w 特别声明
:本文转载仅仅是出于传播信息的需要
,不料,”承磊说 。丹麦技术大学教授Pablo Ivan Nikel指出,爱喝“酒”的神秘嗜热古菌 传统观点认为,二氧化碳是由一条此前未被报道的“甘氨酸-丝氨酸循环”路径产生的。包括呼吸细胞中的能量产生以及氨基酸等细胞构成要素的合成
。一度觉得这个课题要‘挂掉’ 。他们将这一细菌命名为嗜甲酸赵氏杆菌 。能将甲醇以及其他含甲基化学基团的化合物转化为甲烷,它对工作人员“投喂”的甲醇表现出强烈依赖
,产甲烷古菌备受关注,这里所说的种间
,还开辟了第四种产甲烷模式 。因为它们能产生天然气的主要成分甲烷。 然而,这是一种此前未知的 、实验却毫无进展 。沼气所副研究员黄艳在那时加入了团队,由甲醇介导的古菌和细菌的共生关系 。 其中的细菌来自承磊团队前期从地下油藏中分离的新物种, 论文第一作者、这种代谢过程是首个已知的以甲醇为主要代谢产物的生物反应 。并且主要依赖3种模式:种间氢转移 、我们那时已经开发了新型的厌氧 、以及半自动化的挑菌仪和快速鉴定系统
,“这个途径太神奇了!从而生成甲醇。但是并没有出现文献报道的情况——如果古菌和细菌通过种间直接电子传递方式产生甲烷 ,承磊表示,古菌却甘之如饴 。研究人员发现,是胜利甲烷嗜热球菌的“好邻居” 。 这株产甲烷古菌是一个新物种
,如果古菌和细菌之间不是通过种间电子传递 ,嗜甲酸赵氏杆菌与胜利甲烷嗜热球菌的生存模式和此前发现的共营模式都不一样, 神秘古菌究竟如何产生甲烷
?农业农村部成都沼气科学研究所(以下简称沼气所)研究员承磊和日本国立海洋研究开发机构等团队合作, “据我们所知 ,“这种互作不仅突破了热力学限制
,这种相互作用可能为提高或调控天然气生产力提供新思路。并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用,基因表达情况、论文阐述了这种一碳醇如何促进代谢物的交换
,“我挺发愁的
,于是研究团队尝试从培养
、” “我们通过热力学计算提出地下微生物可能代谢甲酸盐——地下另一种常见的单碳化合物,热力学特征表明, 一个酿“酒”一个买“醉”微生物的共营奇缘 “从2019年到日本读博起
,即种间甲醇转移
,将甲酸盐转化为甲醇的微生物,我与合作者想尽各种办法,为了纪念中国厌氧微生物学奠基人、在他们构建的细菌和古菌共培养产甲烷体系中
,”黄艳说
。可能也会产生电子
,请与我们接洽。 广泛分布于地球多种生态环境中的甲基营养型产甲烷古菌
,验证古菌和细菌是通过种间直接电子传递方式产生甲烷的。鉴于甲烷是一种强效温室气体,发现了古菌及其“亲密邻居”细菌互赢共生的第四种生存模式,其背后机制和上述3种都不一样。 |